我是曹勇,2021年6月从北京生命科学研究所董梦秋老师实验室博士毕业,之后留在董老师实验室继续进行交联质谱研究。交联质谱技术(CXMS)使用含有双活性基团的化学小分子将蛋白质的两个氨基酸侧链交联起来,后续通过酶切、质谱采集和软件分析鉴定出交联肽段对。由于交联剂的臂长有限,只有空间距离足够近的两个氨基酸才可能被连接,因此CXMS可以用来研究蛋白质的三维结
构、相互作用以及动态结构。
我博士期间主要工作有两项:1)为了解决交联质谱过度依靠赖氨酸交联剂的问题,我与合作者开发了靶向精氨酸的交联剂ArGO以及同时靶向赖氨酸和精氨酸的交联剂KArGO。它们提供的距离约束能明显提升蛋白质分子对接的精度,是现有交联体系的有力补充。2)系统比较了经典可碎裂交联剂DSSO和不可碎裂交联剂DSS的性能及其差异原因,发现DSS在各种复杂度的样品上都具有优势。该项研究厘清了交联剂发展过程中的混乱,帮助用户正确选用交联剂。今后,我们将聚焦于开发交联肽段的富集技术,将CXMS做到组学水平,并将其应用于构建蛋白质相互作用网络。
导师评语:
曹勇是很少见的一类学生,热情、理想、能力、努力无一缺位,而且独立早熟,在自我奋斗的同时从不忘记关怀他人、帮助集体。
